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20 de abril de 2020

LOS DATOS, Y SU POLÉMICA, EN EL CORONAVIRUS


Extracto del artículo publicado por Sarah Callaghan en la Revista Cell

La recopilación de datos cuando se trata de enfermedades infecciosas es difícil en el mejor de los casos. El aumento de los grandes datos ha brindado a los médicos e investigadores los sistemas y la capacidad de almacenar y trabajar con grandes cantidades de datos, pero en salud pública, los sistemas de vigilancia crítica siguen basándose principalmente en datos obtenidos y codificados manualmente, que son lentos de recopilar y difíciles.


Para una enfermedad como el coronavirus, donde la mayoría de las infecciones son leves depender de los registros del hospital y del médico general para estimar que la propagación puede ser engañosa en las primeras etapas de la progresión de la enfermedad. Los informes tienden a centrarse en la morbilidad y la mortalidad, y es más fácil contar a las personas que realmente se han presentado en los centros de salud para pruebas o atención.

Un hecho clave que todos debemos recordar es que, para la mayoría de los países, en realidad no estamos contando cuántas personas tienen el virus, sino que contamos los informes de cuántas personas tienen el virus y, como todas las métricas, los números varían según cómo se miden. Un aumento en el número de pruebas que se llevan a cabo dará como resultado un aumento en el número de infecciones detectadas.

Dejando a un lado las teorías de conspiración sobre encubrimientos gubernamentales, el simple hecho es que las pruebas de coronavirus son caras. Esto significa que los números recopilados en un país determinado estarán influenciados no solo por la propagación del virus sino también por la capacidad financiera de los centros locales de atención de la salud para realizar la prueba a todos los que presenten inquietudes de que están infectados.

Recopilar datos precisos y comprender las limitaciones de los datos que ya se han recopilado es una parte esencial para comprender la situación. Sin buenos datos, los formuladores de políticas no pueden tomar buenas decisiones. Los científicos de datos pueden ayudar con esto.

Una vez que tenemos datos, las preguntas cambian: ¿Qué pasará después? ¿Cómo se propagará el virus? ¿Qué pasará con la propagación si se implementan ciertas intervenciones no farmacéuticas? ¿Qué tan efectivo es el distanciamiento social en comparación con la cuarentena en todo el país? ¿Cuáles son los impactos a largo plazo de, por ejemplo, cerrar las escuelas durante el próximo mes o más? ¿Cómo podemos rastrear la propagación del virus a través de nuestra comprensión de las redes sociales y el comportamiento humano? ¿Es tan alto el riesgo de contraer el virus si ves el partido de fútbol en el pub en comparación con el estadio?

Es una verdad universalmente reconocida que todos los modelos están equivocados, pero algunos son útiles. La ciencia de datos es necesaria no solo para desarrollar los modelos, sino también para determinar de qué manera están equivocados y de qué manera son útiles, porque los resultados de estos modelos informarán, junto con los datos, las decisiones que se toman para combatir propagación de esta pandemia.

Las infografías y las visualizaciones de datos son una forma útil de poner en perspectiva los riesgos y los números sin procesar. Los científicos de datos tienen la experiencia y los conocimientos para poder poner esta información de manera precisa y útil en un contexto visualmente atractivo y fácil de entender. También pueden crear fuentes de información interactivas y actualizadas continuamente que se basan en los últimos datos, asegurando así que todos estén actualizados con los últimos números.

Hacer que la información correcta sea fácil y atractiva para compartir es crucial en el clima actual, donde la mayoría de las personas obtienen la mayor parte de sus noticias de las redes sociales. Por el contrario, las visualizaciones tienen el potencial de incitar el miedo y la alarma tanto como tienen el potencial de datos o la epidemiología o poca disposición para sumergirse en las citas y suposiciones subyacentes.

Del mismo modo, los informes de situación de coronavirus de la OMS se publican diariamente y son rápidos de leer, con la información principal resumida de manera clara y accesible. Estandarizar la producción y la presentación de informes de estos números es una tarea de ciencia de datos, al igual que producirlos y definirlos
(https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019/situation-reports ).

También tendremos que hacer un balance de algunas de las medidas que se emplearon para hacer frente a la situación. Sí, en tiempos de emergencia, rastrear a las personas infectadas a través de sus teléfonos celulares puede ser lo más sensato para contener la transmisión del virus. Pero una vez que termine la inmediatez de esa situación, tendremos que preguntarnos si hay una manera que podría haberse hecho que no violara la privacidad personal o los otros derechos que tanto apreciamos. ¿Qué estamos dispuestos a aceptar, como sociedad, para garantizar nuestra salud y seguridad? ¿Y qué puede hacer la ciencia de datos para mejorar nuestra salud social y minimizar los efectos en nuestros derechos?

La ciencia de datos se ocupa de números, estadísticas, curvas y distribuciones. Hacemos esto porque es más fácil trabajar con números a escala de población, y nuestras herramientas funcionan mejor cuando se alimentan grandes cantidades de datos.

Si tengo una súplica, es que todos nosotros, científicos de datos o no, recordemos que detrás de esos números hay vidas humanas. Personas reales que están preocupadas y temen por sí mismas o por sus seres queridos. Es bastante fácil calcular una curva de mortalidad que muestre que son los que tienen ≥60 años, o que padecen afecciones preexistentes, los que tienen más probabilidades de morir. Otra cosa es darse cuenta de que esas cifras muestran que son sus padres o abuelos mayores, o sus amigos y familiares inmunocomprometidos, quienes están en mayor riesgo.

12 de abril de 2020

LOS MERCADOS DE ANIMALES VIVOS: FUENTE DE PANDEMIAS


DEGUSTANDO UNA SOPA DE MURCIÉLAGO
Desde tiempos inmemoriales, los mercados de animales vivos han existido en el sudeste asiático, una tradición ancestral. En el mercado Huanan de la ciudad de Wuhan, epicentro de la epidemia del coronavirus, había a la venta, vivos o a trozos, cocodrilos pequeños, puercoespines, perros, ratas de bambú, crías de lobo, avestruces, patos, civetas, carne de camello, marmotas, conejos, serpientes o pavos reales, entre otros animales raros.
Sucede que, en ocasiones, se entremezclan las secreciones de animales vivos con la sangre y desechos de los muertos, lo que supone un  caldo de cultivo ideal para que surjan virus desconocidos.
Eso es lo que ocurrió en el 2002 en el mercado de Qin Ping, en la provincia de Cantón, donde apareció el virus del SARS (síndrome respiratorio agudo severo), que en 9 meses mató a casi 800 personas e infectó a otras 8.422 por todo el mundo. En aquella ocasión, los científicos determinaron que el transmisor de ese coronavirus –emparentado con el de Wuhan– fue una civeta, una especie de gato salvaje muy apreciado por algunos paladares chinos. Aunque entonces el gobierno dictó algunas normas para controlar este tipo de comercio, se ha seguido haciendo al amparo de inspecciones poco rigurosas. También existen mercados de animales vivos en no pocos países asiáticos y en algunos lugares de África. La mayoría de las pandemias tienen al menos una cosa en común: comenzaron su trabajo mortal en Asia o África.
Tras el brote de COVID-19 que ha paralizado el mundo entero, en enero China impuso una prohibición sobre los mercados de animales salvajes para consumo humano, pero lo que sucedió es que se potenció un mercado negro de difícil control.

En cuanto a China en particular, los ecologistas desconfían de la posibilidad de realmente aplicar la ley que prohíbe la venta de animales para consumo humano, recordó Green Queen, una plataforma fundada en 2011  de medios de impacto que aboga por el cambio social y ambiental en Hong Kong.
Aun con la cooperación de las grandes tecnológicas, los comercios que se dedican a esto pueden seguir existiendo por falta de reformas al sistema de licencias chino, que deja muchos huecos por los cuales un negocio de especies exóticas se puede operar sobre uno montado legalmente.
Los científicos creen que el Coronavirus, la primera infección, el comienzo de la diseminación se produjo en el mercado de Wuhan. Esos mercados húmedos (se los llama así porque el suelo está cubierto casi en su totalidad por sangre y agua) constituyen una doble amenaza. Por un lado se somete a los animales a un trato cruel y por el otro son perfectos hábitats, la atmósfera ideal para la transmisión de enfermedades zoonóticas.
Con todo, parece poco creíble que un estado dictatorial como China no pueda cortar de raíz, si quisiera, estas prácticas medievales que comprometen gravemente la salud mundial.